Анализ ДНК на расстоянии одного клика

Анализ ДНК на расстоянии одного клика

Персонализированная медицина будущего — здравоохранение приспособленное под каждого человека — будет нуждаться в дешевом, легком решении обработки огромного количество тестов ДНК. Сегодня, самый большой в мире институт геномики, запустил онлайн сервис, который может помочь тысячам исследователей и медиков, расшифровать ДНК в считанные часы.

Сервис «EasyGenomics» был предложен компанией BGI — гигантской генной лабораторией, расположенной в китайском Шэньчжэне. Используя графические чипы NVIDIA американского производства, компании удалось поставить процесс расшифровывания ДНК на поток. Быстрый графический процессор плюс традиционно мощная вычислительная способность компьютера, уменьшает время, требуемое на проведение анализа ДНК с пяти дней до пяти часов.

«Наша лаборатория позволит широкому кругу исследований ускорить процесс получения данных о ДНК, причем по весьма доступной цене. Мы надеемся на то, что это облегчит использование геномики как для клинического анализа, так и для более комплексного изучения болезни», заявил вице-президент BGI Лин Фанг.

Уже сегодня, исследователи, биологи и врачи могут подписаться на ограниченную бесплатную версию платного сервиса. Институт уже изучает геном многих видов, от гигантской панды до бактерии E. coli, и все это в стремлении сделать нашу медицину более эффективной, улучшить уровень оказания ею помощи и даже создать генетически подходящую еду.

Быстрый, недорогой анализ ДНК должен стать составной частью персонализированной медицины. Понимание генетики болезни пациента, может в конечно итоге, спасти ему жизнь. Подобный онлайн-сервис позволит врачу, сидящему в своем кабинете, послав генетические данные пациента, получить результаты анализ всего за несколько часов.

Стоимость расшифровки генома человека в последние годы последовательно понижается , однако для анализа ДНК все еще необходима большая вычислительная мощность. Вычислительный центр BGI оснащен графическими процессорами NVIDIA, работающими по принципу многозадачности — эта технология уже используется в трех из пяти своременных суперкомпьюетров.

Сервис EasyGenomics от компании BGI «приближает нас к эффективным и доступным персональным лекарствам», говорит Сумит Гупта, главный директор компании NVIDIA.

Стоит отметить, что онлайн сервисы по анализу ДНК начали появляться еще до появления BGI. Сервис Amazon Web Services предлагает исследователям использовать ресурсы своего суперкомпьютера для производства вычислений в одной из самых больших баз данных по человеческому генному — Национальном американском институте Здоровья.

Автор

Запись опубликована 26 Апрель 2012 в разделе Здоровье