Смесь из насекомых – помощь ученым

Смесь из насекомых – помощь ученым

Австралийские исследователи сообщают, что дробленые насекомые предоставляют ученым быстрый и точный способ мониторинга биоразнообразия разных областей.

В прошлом ученые тратили тысячи часов на сбор, классификацию и регистрацию насекомых для того, чтобы понять, какие животные живут в области. Проверка любого изменения их численности требовала проводить тот же самый процесс снова и снова. Новый метод, известный как «мета-штриховое кодирование» (metabarcoding), использует короткие части ДНК для идентификации различных видов из образца, который включает в себя сотни различных животных.

3

Экологи из Университета Гриффита, приняли участие в международном исследовании, в котором сравнивали результаты мета-штрихового анализа с традиционными методами идентификации насекомых. Образцы были собраны из тропических лесов в Малайзии, субтропических лесов Китая и лесов Великобритании. Общая сумма коллекции  насекомых насчитывала 55 813 образцов, которые были разделены пополам. Одну половину тщательно проанализировали традиционным методом. Такая задача потребовала 2505 часов работы таксономических экспертов. Другая половина насекомых была раздроблена в некий «суп» из насекомых. Молекулярные сигналы этой смеси были проанализированы при помощи высоко-чувствительного ДНК секвенсора.

Каждый живой организм содержит ДНК, и даже его небольшие фрагменты могут быть извлечены и использованы для идентификации вида, говорят ученые. Они так же подчеркивают, что в то время как «metabarcoding» был использован ранее, в этом исследовании он впервые применился параллельно с традиционными способами изучения био-диверсификации. Этот способ показал, что для тех, кто заинтересован в установлении количества видов присутствующих в области, этот метод самый подходящий. Он быстр, точен и требует гораздо меньше экспертиз. Но если все же изучается экология области, все равно придется использовать традиционные методы.

Сохранение последствий

Ученые говорят, что логично то, что этот метод может быть применен к любой массе данных, к тому же «мета-штриховое кодирование» уже было использовано для мониторинга численности исчезающих видов животных во Вьетнамских и Лаосских лесах. Здесь исследователи из Всемирного Фонда Дикой Природы и Копенгагенского Университета проанализировали смесь из кровососущих пиявок, чтобы построить список млекопитающих в данном районе, и с этого определить, являлись ли усилия по сохранению видов эффективными.

chambon-1

Поскольку процесс довольно быстрый и относительно недорогой, он может быть повторен регулярно, давая исследователям, быстрое представление об изменениях, происходящих в окружающей среде. Если, что то начнет меняться, ученые будут знать об этом, потому что смесь ДНК, присутствующая в «супе из насекомых» также будет меняться.

Удивительные результаты

Хотя «мета-штриховое кодирование» доказало свою ценность в ходе исследования, были еще несколько сюрпризов. Образцы насекомых были привезены из Китая. Ученые были заинтересованы в разнообразии мотыльков и для их поимки были установлены световые ловушки. Но после проведения анализов исследователи обнаружили не только ДНК насекомых, но также и молекулярные код трех куропаток.

Исследователи были немного озадачены тем, что обнаружили ДНК птиц в образцах насекомых, пока не поняли, что в дополнение к мотылькам, они поймали комаров и кровососущих мух. От них та и появился ДНК куропаток.

Автор

Запись опубликована 9 Август 2013 в разделе Экология